A prevenção e controle de infecções é a aplicação clínica da microbiologia na prática. Pode ser causada por vírus, bactérias, fungos, etc. É necessário prevenir a transmissão de doenças transmissíveis em todos os ambientes de assistência à saúde. A equipe de controle desenvolve, implementa e avalia estratégias e programas para prevenir e controlar doenças infecciosas.