Abordagens proteômicas para a identificação de biomarcadores de doenças dependem principalmente da análise comparativa da expressão de proteínas em tecidos normais e doentes para identificar proteínas expressas de forma aberrante que podem representar novos biomarcadores, análise de proteínas secretadas (em linhagens celulares e culturas primárias) e proteínas séricas diretas perfis. As metodologias de proteômica incluem a avaliação da expressão de proteínas (por Western blotting e ensaio de imunoabsorção enzimática e por outros métodos baseados em anticorpos) e o isolamento, identificação e quantificação de proteínas em bioamostras com eletroforese em gel bidimensional de alta resolução, alto desempenho cromatografia líquida, cromatografia de superfície por adsorção de proteínas a superfícies ativadas (tecnologia de dessorção-ionização a laser assistida por matriz),